Στο πλαίσιο επίσημης επίσκεψης του τότε Έλληνα Πρωθυπουργού στην Σλοβενία που πραγματοποιήθηκε το Νοέμβριο του 2001 υπογράφηκε Συμφωνία Συνεργασίας στον τομέα της γεωργίας από τους δύο ομόλογους Υπουργούς Γεωργίας των δύο χωρών.

Η υπογραφή της Συμφωνίας εντάχθηκε στη γενικότερη πολιτική της χώρας μας για ενίσχυση της συνεργασίας με τις τότε υποψήφιες για ένταξη ευρωπαϊκές χώρες και με όλες τις χώρες της ευρύτερης περιοχής που βρίσκονταν σε μεταβατικό στάδιο και παρουσίαζαν θεσμικές αδυναμίες σε θέματα τεχνογνωσίας, επιστημονικής κατάρτισης και  βελτίωσης της διοικητικής ικανότητας.

Η ταχεία ωστόσο πρόοδος της Σλοβενίας σε όλους τους τομείς, της επέτρεψαν να ολοκληρώσει επιτυχώς τις διαπραγματεύσεις ένταξης και να ενταχθεί στην Ε.Ε. ως πλήρες μέλος από το 2004. Έκτοτε, οι διμερείς σχέσεις των δύο χωρών στον αγροτικό τομέα εξελίσσονται ομαλά και ιδιαιτέρως φιλικά στο πλαίσιο των κοινοτικών διαδικασιών και διαβουλεύσεων. Ως εκ τούτου, η διμερής Συμφωνία μεταξύ των δύο Υπουργείων παρέμεινε πρακτικά ανενεργή.

Πέραν των άλλων, η Σλοβενία είναι μέλος του Διεθνούς Συμβουλίου Ελαιολάδου και παρουσιάζει έντονη δραστηριοποίηση στην ανάπτυξη του τομέα της ελαιοκομίας με νέες φυτεύσεις.