Οι μακρόχρονες σχέσεις συνεργασίας Ελλάδας-Κύπρου στον τομέα της γεωργίας διέπονται από διμερή Συμφωνία μεταξύ των Κυβερνήσεων των δύο χωρών από το 1988, η οποία έχει κυρωθεί από την Ελληνική Βουλή με το Νόμο 2016/20.02.1992 (ΦΕΚ Α΄ 31/1992).  Σύμφωνα με το άρθρο 4 της Συμφωνίας, προβλέπεται υπογραφή διετών Προγραμμάτων Συνεργασίας μεταξύ των δύο ομόλογων Υπουργείων Ελλάδας-Κύπρου.

Καθ' όλη την προενταξιακή περίοδο, οι διμερείς σχέσεις υπήρξαν ιδιαίτερα στενές και εξακολουθούν να είναι εξαιρετικά καλές. Η άριστη συνεργασία των Υπουργείων Γεωργίας των δύο χωρών χαρακτηρίζεται από σταθερότητα και αποτελεσματικότητα.

Η Μικτή Επιτροπή Προγραμματισμού, που συνέρχεται εναλλακτικά στην Αθήνα και στη Λευκωσία καταρχήν ετησίως, επεξεργάζεται και καταρτίζει ετήσια Προγράμματα Δραστηριοτήτων, με βάση τις προτάσεις των  υπηρεσιών των Υπουργείων Γεωργίας των δύο χωρών για την υλοποίηση των προαναφερθέντων Προγραμμάτων Συνεργασίας.

Η συνεργασία υλοποιείται με ανταλλαγές επισκέψεων εμπειρογνωμόνων, επιμόρφωση προσωπικού, ανταλλαγή πληροφοριών, διευκόλυνση επισκέψεων αγροτών και αγροτισσών, σε τομείς όπως γεωργικής έρευνας, δασών, αλιείας, υδατικής ανάπτυξης - γεωλογικής επισκόπησης, κτηνιατρικών υπηρεσιών και γεωργικής ασφάλισης.

Το τελευταίο διετές πρόγραμμα συνεργασίας που είχε συμφωνηθεί για την περίοδο 2006-2008 υλοποιήθηκε πλήρως. Στη φάση αυτή, οι υπηρεσίες των ομόλογων Υπουργείων των δύο χωρών βρίσκονται σε συνεννόηση για την υπογραφή νέου διετούς προγράμματος που θα ισχύσει το προσεχές διάστημα.